報告題目:破譯體細胞突變在人類發(fā)育、衰老和疾病中的作用
報告人: 黃岳
報告時間:2023年6月8日(星期四)10:00
報告地點:線下:新環(huán)境樓8F-807,線上:騰訊會議ID 784-861-734 會議密碼 0608
邀請人: 張琨
報告摘要:
體細胞突變(somatic mutation)是指某些組織或者器官的細胞后天性發(fā)生的DNA改變,它們長期以來被認為在癌癥中起著關(guān)鍵作用。但是,由于體細胞突變在非癌癥細胞中發(fā)生率很低,將它們與種系突變(germline mutation)和測序錯誤區(qū)分開來存在長期的技術(shù)挑戰(zhàn)。在北京大學攻讀博士學位期間,黃岳領(lǐng)導開發(fā)了MosaicHunter,這是第一個能夠從非癌癥全基因組和外顯子組測序數(shù)據(jù)中系統(tǒng)地識別體細胞突變的計算工具;通過應用這一強大的工具率先發(fā)現(xiàn)了體細胞突變在健康個體各種組織的分布特征以及其在多種發(fā)育疾病(包括自閉癥、動靜脈畸形和 Rett 綜合征等)中的致病貢獻。隨后,黃岳在波士頓兒童醫(yī)院和哈佛醫(yī)學院接受博士后培訓期間,開始利用尖端基因組技術(shù)以單細胞分辨率研究體細胞突變,開發(fā)了一種可以同時分析數(shù)千個單細胞的 DNA和RNA 的新方法PRDD-seq,并使用體細胞突變作為內(nèi)源性細胞譜系標記,探索了人類大腦中多種神經(jīng)細胞類型的發(fā)育時空模式。通過使用單細胞全基因組測序,揭示了非分裂細胞(包括神經(jīng)和心肌細胞)中體細胞突變隨年齡的積累速率和模式;還發(fā)現(xiàn)阿爾茨海默病患者的神經(jīng)細胞比健康對照攜帶更多的體細胞突變,并且這些突變的發(fā)生與疾病特異性的氧化損傷有關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)強調(diào)了體細胞突變這一以前被忽視的遺傳因素在人類發(fā)育、衰老和疾病中的重要作用。
報告人簡介:
黃岳博士于2014年在北京大學獲得生物信息學博士學位,導師為魏麗萍教授。2015-2022年在波士頓兒童醫(yī)院和哈佛醫(yī)學院歷任博士后、講師,師從體細胞突變和神經(jīng)疾病領(lǐng)域領(lǐng)軍人物Christopher Walsh和Alice Lee。2023年起受聘于波士頓兒童醫(yī)院和哈佛醫(yī)學院擔任生物信息學和基因組學實驗室PI,致力于開發(fā)和應用最先進的高通量測序和基因組學方法研究體細胞突變在人類發(fā)育、衰老和疾病中的特征和貢獻。以第一或通訊作者(含并列)在Nature、Nat Aging、PNAS、Cell Res、Genome Res、Nucleic Acids Res、AJHG等高水平期刊上發(fā)表文章13篇,總引用數(shù)超過1500次。